Stats for Strand Specific P. adspersus RNA-Seq assembly

srlab@emu:~/Documents/marco/trinity_out_dir$ /home/shared/trinityrnaseq-Trinity-v2.4.0/util/TrinityStats.pl Trinity.fasta
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## Counts of transcripts, etc.
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Total trinity ‘genes’: 113880
Total trinity transcripts: 208395
Percent GC: 46.44

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Stats based on ALL transcript contigs:
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Contig N10: 5287
Contig N20: 4212
Contig N30: 3519
Contig N40: 2979
Contig N50: 2490

Median contig length: 660
Average contig: 1292.22
Total assembled bases: 269293138
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## Stats based on ONLY LONGEST ISOFORM per ‘GENE’:
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Contig N10: 5308
Contig N20: 4134
Contig N30: 3384
Contig N40: 2771
Contig N50: 2196

Median contig length: 361
Average contig: 892.92
Total assembled bases: 101686116

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